Что было объектом исследования в опытах Л. Пастера?

Коротко: микроорганизмы — прежде всего бактерии и дрожжи.

Пастер ставил свои знаменитые опыты (в т.ч. с «лебедиными» колбами) именно на питательных бульонах и сахаристых растворах, чтобы показать, что процессы брожения и гниения вызывают живые микробы, попадающие из воздуха. Он изучал, как эти микроорганизмы заселяют стерильные среды, какова их роль в различных видах брожения (алкогольном — дрожжи, молочнокислом — бактерии и т. д.) и почему без заноса микробов стерильные среды не «портятся».