Поставить запятую В ПРЕДЛОЖЕНИИ.Он не знал что делать с мышкой

Запятая в данном предложении не ставится, поскольку оно является сложноподчинённым. В данном случае "что делать с мышкой" — это придаточное предложение, которое поясняет, что именно он не знал. Однако, запятая не требуется, потому что придаточное предложение тесно связано с главным и не отделяется запятой.

Правильное написание: Он не знал что делать с мышкой.