Крышей,лужей, фаршем где писать букву о?

Во всех трёх словах пишется буква «о»: крышей, лужей, фаршем.

Почему так:

1. Крышей — форма творительного падежа слова крыша (крыша — крышей).
   После шипящих ж, ш, ч, щ в окончаниях существительных и прилагательных под ударением обычно пишется -о-, а не -е-: крыша — крышей.

2. Лужей — форма творительного падежа слова лужа (лужа — лужей).
   Тут работает то же правило: после ж в окончании под ударением пишется о (на письме это видно как -ой- / -ей- в зависимости от формы, но в данном случае нормативно: лужей).

3. Фаршем — форма творительного падежа слова фарш (фарш — фаршем).
   После ш в окончании также пишется о: фаршем.

Итог: правильно крышей, лужей, фаршем — везде «о».