И всем сразу стало ясно, что она пришла к ним за тем, чтобы сделать то, что хочет. Сколько грамматических основ?

В этом предложении 4 грамматические основы.

Разберём по частям (это сложное предложение с несколькими придаточными):

1. Главная часть:
   «…стало ясно» — безличная основа (подлежащего нет, сказуемое выражено составным именным: стало ясно).
   ➡️ Основа: стало ясно.

2. Придаточное изъяснительное:
   «что она пришла к ним…»
   ➡️ Основа: она пришла (подлежащее она + сказуемое пришла).

3. Придаточное цели:
   «чтобы сделать то…»
   Здесь сказуемое выражено инфинитивом сделать, подлежащее подразумевается (она). В школьном разборе это всё равно считается отдельной грамматической основой.
   ➡️ Основа: (она) сделать / фактически сделать.

4. Придаточное определительное (к слову “то”):
   «что хочет»
   ➡️ Основа: (она) хочет / фактически хочет.

Итого: стало ясно + она пришла + сделать + хочет = 4 грамматические основы.