Разнообразие окраски водорослей вызвано:

Разнообразие окраски водорослей обусловлено прежде всего составом и соотношением их фотосинтетических пигментов в хлоропластах. У разных групп доминируют разные дополнительные (акцессорные) пигменты, которые «маскируют» зелёный хлорофилл и придают характерный цвет:

• Зелёные водоросли — преобладают хлорофиллы a и b → зелёная окраска.

• Бурые водоросли и диатомовые — много ксантофилла фукоксантина (плюс хлорофиллы a и c) → буро-золотистая.

• Красные водоросли — фикоэритрин и фикоцианин (фикобилипротеины) перекрывают хлорофилл a → красная/пурпурная.

• Синезелёные (цианобактерии) — фикоцианин и фикоэритрин в разных пропорциях → от синевато-зелёной до красной.

Дополнительно оттенки зависят от условий освещения и глубины (какие длины волн лучше проникают в воду — те пигменты и «выгоднее»), а также от физиологического состояния клетки и накопления некоторых веществ в пластидных включениях. Главная причина, однако, — именно набор и количественное соотношение хлорофиллов, каротиноидов и фикобилипротеинов.