Источник питания реки Юкон.

Юкон имеет смешанное питание. Главную роль играет снеговое (весенне-раннелетний паводок от таяния снежного покрова в субарктических и горных районах). Существенную долю добавляет дождевое питание летом (летние подъёмы стока после ливней), а в верховьях и притоках из хребтов — ледниковое питание в тёплый сезон. Подземное питание присутствует, но второстепенно. В итоге годовой режим: высокий сток в мае–июне за счёт снега, поддержка летом дождями и таянием ледников, очень низкая межень зимой.