Корни слов "комбайн", "агроном", "капуста".

Комбайн — корень комбайн- (заимствованное слово; в русском не расчленяется на меньшие значимые части), нулевое окончание.

Агроном — корень агроном- (в школьной морфемике рассматривается как цельный корень; хотя по происхождению восходит к греч. агро- «поле» и -ном- «закон/управление»), нулевое окончание.

Капуста — корень капуст-, окончание -а (проверка формой капуст-ы подтверждает корень).